Медицинско-профилактический центр открыт на базе Ненецкой средней школы имени А.П. Пырерки.
Как отметила директор школы Людмила Пашкина: «Основными задачами Центра являются — психолого-педагогический мониторинг состояния здоровья, физического и психического развития школьников, обеспечение коррекции развития детей без отрыва от учебы, повышение компетенции педагогов по применению здоровьесберегающих образовательных технологий, включение семьи в здоровый образ жизни».
Для реализации поставленных задач в Центре здоровья работают школьный врач, медицинские сестры, педагоги-психологи, социальные педагоги, учитель-логопед, дефектолог, воспитатели и другие специалисты. Работа Центра организована по направлениям: медицинская диагностика, психология, социальная поддержка и адаптация, коррекция , физкультурно-массовая и просветительская деятельность.
Сегодня Центр работает только с учениками школы имени А.П. Пырерки, где учится 234 ребенка, из них — 113 уроженцев окружных сел и 23 ребенка-сироты. Также с января 2017 года в составе учреждения числится Ненецкая санаторная школа-интернат, где находятся дети с ослабленным здоровьем и рисками социально-значимых заболеваний.
На перспективу планируется организовать работу по сохранению здоровья всех школьников Ненецкого региона.